En el África Austral, Oriental y el océano Índico, el IRD interviene en contextos continentales e insulares que presentan grandes contrastes en términos de desarrollo y combina una gran variedad de campos científicos, como las ciencias marinas, el cambio climático, la salud, el medio ambiente y las ciencias sociales. El Instituto adopta una lógica de cooperación regional que engloba sus centros en los territorios franceses de ultramar, así como sus colaboraciones Sur-Sur.
Del 14 al 17 de mayo de 2018, el IRD celebró sus 70 años de cooperación científica en Madagascar. Con motivo de este aniversario, el Instituto y sus socios organizaron varias actividades dedicadas a la ciencia y la cultura científica.
Este coloquio se celebró del 23 al 26 de octubre de 2018 en Ciudad del Cabo. Durante las siete sesiones temáticas se sucedieron 37 presentaciones.
Del 26 al 28 de octubre de 2018 se celebró en Nairobi la primera Conferencia Internacional para la Economía Azul Sostenible, impulsada por Kenia, Canadá y Japón. Reunió a 15.000 participantes que debatieron sobre la contribución de los océanos, los mares, los lagos y los ríos a la consecución de los objetivos del Programa de Desarrollo Sostenible de las Naciones Unidas para 2030.
El grupo de expertos del Informe Mundial sobre el Desarrollo Sostenible (GSDR) organizó un taller regional de consultas el 12 de mayo de 2018 en Port Elisabeth (Sudáfrica) como complemento a la conferencia de Future Earth «Seedbeds of Transformation: the Role of Science with Society and the SDGs in Africa» (del 9 al 11 de mayo).
El IRD lleva más de 10 años trabajando en la TIS. Tras una fase de experimentación en laboratorio, el objetivo de la fase 2 del proyecto (2016-2018) era evaluar la viabilidad técnica, económica y social del programa para valorar su futura puesta en práctica en el medio natural.
El GDRI-Sur DELTAS se creó en 2018 para consolidar una red de investigación internacional sobre las dinámicas socio-ambientales de los deltas del océano Índico occidental. Se apoya en las colaboraciones a largo plazo del IRD en la región y en un consorcio, WIoDER, que agrupa a investigadores y estudiantes africanos (Kenia, Tanzania, Madagascar y Mozambique) y europeos (Francia, los Países Bajos y el Reino Unido).
El FARI se basa en la necesidad de garantizar una mayor participación de las instituciones de investigación y las universidades presentes en la región, así como de contribuir a la puesta en marcha del componente de evaluación del Convenio de Nairobi. Esta organización de las Naciones Unidas aboga por la protección, la gestión y la revalorización del medio marino y costero de la zona occidental del océano Índico. El IRD se unió al FARI en 2018 y en agosto pudo proponer actuaciones de gobernanza de la zona de alta mar y de los montes submarinos en la COP9 del Convenio de Nairobi.