La zona del Pacífico se caracteriza por su excepcional biodiversidad y por ser especialmente sensible a los cambios globales. En este ámbito, el IRD cubre diversas disciplinas: oceanografía, recursos naturales terrestres y marinos, minas y riesgos naturales, salud, sociedad y medio ambiente, etc. El Instituto cuenta con dos representantes en esta zona, en Nueva Caledonia y la Polinesia Francesa.
En el marco del año internacional de los arrecifes de coral y la celebración de los 10 años de su inscripción en el Patrimonio Mundial de la UNESCO, se publicó la obra Lagunas y arrecifes de coral: pilares de una sociedad y fuentes de bio-inspiración. Además, en 2018 se organizaron una decena de actividades sobre los arrecifes coralinos.
En octubre de 2018, el IRD y la Universidad de la Polinesia Francesa participaron en la organización de esta cita que reunió a más de 130 personas de 15 universidades y 11 territorios distintos para debatir sobre el tema: «Saberes tradicionales, saberes académicos y orientación de la investigación universitaria en la región del Pacífico».
Los días 19 y 20 de noviembre de 2018 se celebró en Nueva Zelanda un taller de estudio sobre la viabilidad del reconocimiento de la personalidad jurídica del océano Pacífico. El IRD y sus socios plantearon esta iniciativa durante el Día Mundial de los Océanos de 2017.